1948년 동아대학교 축구반을 창설하여 김화집 감독의 지휘 아래 1948년 5월 경남중등학교 축구선수권대회 우승을 필두로 1955년 경남축구선수권대회를 우승하였으며, 1974년 길상태 감독이 취임하며 각종 대회를 석권하였다.
1978년부터 1991년까지 지휘봉을 이어 받은 서현옥 감독은 전국대회 우승 4차례 등 상위권을 포효하였고 뒤를 이은 박무웅 감독은 1992년 전국체육대회에서 우승하였다.
2000년부터 2012년까지 지휘봉을 잡은 최영일 감독은 각종 대회에서 선두권을 지키며 2009년 전국춘계대학축구연맹전에서 우승하였다.
2014년부터 2019년까지 지휘봉을 잡은 김우재 감독은 2014년 카페베네 U리그전에서 10권역 2위를 달성하였다.
2013년, 현재 지휘를 맡고 있는 백승우 감독은 2013년 카페베네 U리그전에서 10권역 3위에 올랐다.